【作者介绍】
廖娟红：华中农业大学预防兽医学硕士，长期从事实验室分子研发和一线拔牙工作，实践经验丰富，主导省级重点研发项目2项，参与发表核心期刊论文 14 篇，专利 29 项 。
自2018年国内首次出现非洲猪瘟Ⅱ型毒株疫情以来，短短几年时间，不同基因型、不同毒力的非洲猪瘟病毒株相继被报道。2020年6月报道发现了CD2v自然突变或缺失毒株，该类毒株表现出中等毒力，高传播性；2021年6月，在山东、河南首次发现非洲猪瘟基因Ⅰ型毒株，该毒株具有低致病性和高传播力的特点；同时还有CD2v、MGF基因缺失毒株， I177L基因缺失疫苗株和其他包含有eGFP、mCherry荧光标记基因的人工改造毒株的威胁。近期，2023年5月，哈兽研首次报道了非洲猪瘟Ⅰ/Ⅱ型重组毒株，该毒株与基因Ⅱ型强毒株相似，表现出高致死性、强传播力的特征。
面对如此多类型的非瘟毒株，特别是最新报道的非瘟Ⅰ/Ⅱ型嵌合毒株，养殖企业该如何及时、准确的进行鉴别呢？
参考科研进展与国内的实际情况，主要有两种方案可以实现非瘟毒株的鉴别诊断：全基因组测序和荧光定量PCR检测。
一、全基因组测序
全基因组测序无疑是目前最权威、最准确的鉴别方法。随着科学技术的发展，很多悬而未决的临床毒株可以通过全基因组测序给出明确的结论。以往的非瘟毒株只需针对用于基因分型的p72核苷酸片段进行测序，便能给出明确的分型结论。但对于新出现的非洲猪瘟Ⅰ/Ⅱ型嵌合毒株，其基因组由10个基因I型同源片段和10个基因II型同源片段呈不连续性交叉式排布组成。该毒株的p72来源于基因Ⅰ型毒株，而CD2v来源于基因Ⅱ型毒株。需同时对多个基因片段进行测序，这无疑对检测成本和时效性都是一个巨大的挑战。
二、荧光定量PCR检测及时准确
非洲猪瘟毒株类型众多，临床情况复杂多变，针对目前新报道的Ⅰ/Ⅱ型嵌合毒株是否可以通过荧光定量PCR实现其与基因Ⅰ型、基因Ⅱ型毒株的鉴别诊断呢？
众所周知，对于非瘟Ⅰ型的鉴别，可通过特异性检测p72序列上的4个碱基差异实现与Ⅱ型毒株的鉴别。随着非洲猪瘟I/II型嵌合毒株的出现，其独特的序列特征给非洲猪瘟的分型带来了新的挑战，已无法仅通过对p72的检测，实现非瘟Ⅰ型毒株、Ⅱ型毒株和Ⅰ/Ⅱ型嵌合毒株的鉴别。
展开全文
随着哈兽研对Ⅰ/Ⅱ型嵌合毒株的深入研究，其科研成果为我们提供了更多基于荧光定量PCR方法进行基因分型的理论依据。
如上图所示，图中可以看到Ⅰ/Ⅱ型嵌合毒株（Ⅰ型强毒株）、I型毒株和II型毒株有着明确的基因序列差异位点，基于此可以应用荧光定量PCR方法，采用一款多联检试剂，一次上机，实现低成本的鉴别Ⅰ/Ⅱ型嵌合毒株、I型毒株（弱毒）和II型毒株，为非瘟防控提供更及时准确的决策依据。
三、测评
为验证荧光定量PCR方法鉴别Ⅰ/Ⅱ型嵌合毒株、I型毒株（弱毒）和II型毒株的准确性，某公司将检测结果与测序结果进行对比，结果完全吻合（如下表所示）。
四、非洲猪瘟病毒检测方案
如文章开头描述的，田间的毒株类型更加复杂多样，我们该如何鉴别其他毒株，如何通过荧光定量PCR的方式快速准确的区分毒株类型，以便结合临床数据做到精准防控？
*注：由于临床的复杂性，可能存在混合感染。
公司简介：
冠牧精准诊断（湖南冠牧生物科技有限公司）聚焦于动物体外诊断试剂和设备领域，提供精准的动物疫病诊断试剂和设备，公司开发了猪病、禽病、反刍动物、水生动物荧光PCR试剂和抗体检测试剂，搭配配套的荧光定量PCR仪、核酸自动提取仪、酶标仪等设备，能够精准的诊断动物传染病，指导疫病防控。返回搜狐，查看更多